Seriál získal řadu ocenění a nominací. V první tabulce najdete seznam ocenění a v druhé tabulce seznam nominací.
Výhra
| Ocenění | Rok | Kategorie | Herec/Práce |
| ALMA Award | 2011 | Oblíbená TV herečka – hlavní role v dramatu | Cote de Pablo |
| ASCAP Award | 2004 | Nejlepší TV seriál | Steven Bramson |
| ASCAP Award | 2004 – 2012 | Nejlepší TV seriál | Matt Hawkins, Maurice Jackson, Neil Martin |
| BMI Film & TV Awards | 2005 | BMI TV Music Award | Joseph Conlan |
| BMI Film & TV Awards | 2008, 2009 | BMI TV Music Award | Brian Kirk |
| California on Location Awards | 2008 | Location team of the year (Episodic television) | Emily Kirylo, Jim McClafferty, Joel Sinderman, Michael Soleau |
| Imagen Foundation Awards | 2006 | Nejlepší herečka ve vedlejší roli/TV | Cote de Pablo |
| Televizní festival v Monte Carlu | 2014, 2015 | Cena mezinárodních televizních diváků za drama | NCIS |
| Young Artist Awards | 2011 | Nejlepší výkon v TV seriálu – hostující mladá herečka 11 – 15 | Madisen Beaty |
Nominace
| Ocenění | Rok | Kategorie | Herec/Práce |
| ALMA Award | 2008 | Vynikající herečka v dramatickém TV seriálu | Cote de Pablo |
| ALMA Award | 2009 | Rok v TV dramatu – herečka | Cote de Pablo |
| ALMA Award | 2012 | Oblíbená TV herečka – drama | Cote de Pablo |
| Emmy Awards | 2005 | Vynikající hostující herec v dramatickém seriálu | Charles Durning |
| Emmy Awards | 2008 | Vynikající koordinace kaskadérů | Diamond Farnsworth, díl Requiem |
| Imagen Foundation Awards | 2009 | Nejlepší herečka ve vedlejší roli/TV | Cote de Pablo |
| Imagen Foundation Awards | 2011 | Nejlepší herečka/TV | Cote de Pablo |
| NAACP Image Awards | 2010 | Vynikající herec ve vedlejší roli v dramatickém seriálu | Rocky Carroll |
| People’s Choice Awards | 2009, 2010 | Oblíbené TV drama | NCIS |
| People’s Choice Awards | 2015 | Oblíbená TV show | NCIS |
| People’s Choice Awards | 2009, 2013, 2014, 2016 | Oblíbený TV herec v dramatu | Mark Harmon |
| People’s Choice Awards | 2014, 2016 | Oblíbená TV herečka v dramatu | Pauley Perrette |
| People’s Choice Awards | 2011, 2012, 2014, 2016 | Oblíbené TV krimidrama | NCIS |
| Young Artist Awards | 2008 | Nejlepší výkon v TV seriálu – hostující mladý herec | Dominic Scott Kay, díl Ztráty a nálezy |
| Young Artist Awards | 2011 | Nejlepší výkon v TV seriálu – hostující mladá herečka 11 – 15 | Sadie Calvano |
| Young Artist Awards | 2012 | Nejlepší výkon v TV seriálu – hostující mladá herečka pod 10 let | Melody Angel |